和其他抗精神病药相比，阿米舒必利导致锥体外系反应（EPS）的概率较低，因此即使推荐服用最大治疗剂量范围内（200-400）mg?d-1几乎是不会出现肌张力障碍和静坐不能等锥体外系反应。也不易会出现体重增加及代谢异常等不良反应的发生率，耐受性良好。
服用阿米舒必利其他常见的不良反应有血浆催乳素水平升高导致男子乳腺发育、乳房肿胀、失眠、嗜睡、焦虑、激越、便秘、恶心、呕吐等，只有少量的会出现急性肌张力障碍、迟发运动障碍、低血压、心动过缓和QT间期延长等。长期服用可能引发的迟发性运动障碍主要表现为不自主的舌或颊部运动，若服用抗胆碱能类抗震颤麻痹药不仅不能起到治疗作用，还会加重症状。有外国文献报道服用大剂量的阿米舒必利可能会引起Q-T间期延长，通过各种研究发现它产生的不良反应中Q-T间期延长是极少发生的。
由于阿米舒必利为DA能受体阻断剂，禁忌与DA能激动剂金刚烷胺、溴隐亭等联合使用，也不建议和奎尼丁、胺碘酮等药物联合用，因为这些药物可能会引起尖端扭转性室性心动过速；和硫利达嗪、三氟拉嗪、硫必利、氟哌啶醇等某些精神抑制药联合用药要慎重；如果和维拉帕米、可乐定、多奈哌齐、加兰他敏、新斯的明等联合应用，会增加室性心律失常的风险，尤其是尖端扭转性室性心动过速，更要谨慎使用。服用该药时要避免饮酒，因为它和酒合用会使血浆浓度上升20%左右。
和其他非典型抗精神病药物相比，阿米舒必利与受体有新的结合位点，对神经系统功能作用不同于其他非典型抗精神病药物，它不仅能改善精神分裂症患者的阳性症状、阴性症状以及情感症状，还能显著改善认知功能，而且存在的不良反应很少，对糖、脂质代谢的影响极低，因此使用安全性和疗效很好。（编辑：姜惠）